546-0824 – Mikrobiologie III (MB III)

Cílové kompetence v oblasti osvojení nových poznatků a jejich aplikace při řešení problémů, při pozorování, experimentování i v oblasti komunikační: - charakterizovat fenotypové a genotypové znaky základních skupin mikroorganismů - chápat postavení mikroorganismů v rámci ekosystémů, orientovat se v přirozených systémech a chápat fylogenetické a biotické vztahy jednotlivých skupin - chápat postavení mikroorganismů v rámci druhové diverzity a faktory ovlivňující její stabilitu v rámci ekosystému - chápat význam mikroorganismů v koloběhu látek v prostředí - schopnost vyhodnotit vhodnost určitého mikroorganismu pro konkrétní biotechnologický postup s ohledem na ekologické důsledky tohoto rozhodnutí - získané vědomosti umět využívat při řešení praktických úloh na cvičení, posoudit důsledky určitého jevu z hlediska ekologického, zdravotního i ekonomického; dotvářet si kladný vztah k přírodě - schopnost samostatného řešení zadaných úloh, pozorovat a objektivně zaznamenávat výsledky experimentů, při práci s biologickým materiálem i technickými přístroji dodržovat zásady bezpečné (aseptické) práce - schopnost pracovat s cizojazyčným odborným textem, zvládnout odbornou terminologii, orientovat se v základních databázích (Genbank, EMBL, FASTA) a ve světových sbírkách mikroorganismů - schopnost synteticky vyhodnotit získané experimentální údaje, obhájit svůj názor na řešení biologického problému

Předmět obsahově navazuje na poznatky z obecné a speciální mikrobiologie získané v bakalářském stupni studia a rozšiřuje znalostní základ o zobecňující pohled na postavení mikroorganismů v přírodě, druhovou diverzitu a vztahy mezi populacemi mikroorganismů v rámci ekosystémů. Samostatná profilace předmětu odráží postavení moderní mikrobiologie jako multidisciplinárního oboru na rozhraní ekologických, biologických (genetických) a technických věd. Předmět je zaměřen na mikrobiologii ekosystémů, studenti získají informace o významu mikroorganismů v širších ekologických souvislostech, o typologii mikroorganismů z hlediska jejich fenotypu a genotypu včetně moderních databází, o moderních informačních zdrojích, o možnosti jejich praktické aplikace v moderních biotechnologiích; část přednášek je věnována praktickému využití mikroorganismů k detekci mutagenů v životním prostředí a jejich úloze v degradačních technologiích i úpravnických procesech.

KLABAN, Vladimír. Ekologie mikroorganismů: Ilustrovaný lexikon biologie, ekologie a patogenity mikroorganismů. Praha: Galén, 2012. 549 s. ISBN 978-80-7262-770-7 MALACHOVÁ, Kateřina. Ekologie mikroorganismů. Ostrava: Ostravská univerzita, 2004. 86 s. ISBN: 978-80-7042-996-8 ŠUTA, Miroslav. Biotechnologie, životní prostředí a udržitelný rozvoj. Praha: Společnost pro trvale udržitelný život, 2007. 27 s. ISBN 978-80-902635-1-2 TOWNSEND, Collin R., Michael BEGON a John L. HARPER. Základy ekologie. Univerzita Palackého v Olomouci, 2010. 505 s. ISBN 978-80-244-2478-1

ALBERTS, Bruce et al. Základy buněčné biologie. Úvod do molekulární biologie buňky. Ústí nad Labem: Espero Publishing, 1998. 603 s. ISBN 80-902906-2-0