546-0169/01 – Základy zpracování environmentálních dat (ZZED)
| Garantující katedra | Katedra environmentálního inženýrství | Kredity | 3 |
| Garant předmětu | Mgr. Oldřich Motyka, Ph.D. | Garant verze předmětu | Mgr. Oldřich Motyka, Ph.D. |
| Úroveň studia | pregraduální nebo graduální | Povinnost | povinný |
| Ročník | 2 | Semestr | zimní |
| | Jazyk výuky | čeština |
| Rok zavedení | 2021/2022 | Rok zrušení | |
| Určeno pro fakulty | HGF | Určeno pro typy studia | bakalářské |
Cíle předmětu vyjádřené dosaženými dovednostmi a kompetencemi
Studenti se naučí analyzovat a hodnotit kvantitativní, semikvantitativní i kvalitativní environmentální (biologická) data. Budou schopni tato data správně popsat a vizulaizovat s využitím základních charakteristik deskriptivní statistiky, identifikovat a ověřit chybné a odlehlé hodnoty a rozdělení, z něhož environmentální data pocházejí. Rovněž budou schopni formulovat statistickou hypotézu, použít vhodné testové statistiky a správně interpretovat výsledky. Získají rovněž základní dovednosti v rámci korelační a regresní analýzy biologických dat.
Vyučovací metody
Cvičení (v učebně)
Anotace
Studenti budou seznámeni se základními způsoby přípravy vzorkovacího plánu, sběru, úpravy a hodnocení environmentálních dat. Naučí se správně používat a interpretovat základní statistické metody s ohledem na specifika environmentálních – biologických i chemických – dat. Seznámí se rovněž se základy biostatistických modelů a statistickým hodnocením diverzity. Práce s daty bude probíhat pomocí nástrojů MS Excel a programu R a jeho knihoven.
Povinná literatura:
Doporučená literatura:
Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta
Aktivní účast na cvičeních. Zpracování a odevzdání zadaných protokolů. Obhajoba semestrální práce.
Předmět je ukončen klasifikovaným zápočtem.
E-learning
Submission of assigned protocols.
Semester work.
Další požadavky na studenta
účast na cvičeních
projekt - vyhodnocení dat
zápočtový test
Prerekvizity
Předmět nemá žádné prerekvizity.
Korekvizity
Předmět nemá žádné korekvizity.
Osnova předmětu
1. Příprava vzorkovacího plánu, uchovávání a ukládání biologických dat.
2. Typy biologických dat – kvantitativní a kvalitativní data, popis, charakteristiky polohy a variability, vizualizace, identifikace odlehlých hodnot.
3. Úvod do testování hypotéz – nulová a alternativní hypotéza, chyby I. a II. druhu, statistický test a jeho síla, p – hodnota.
4. Statistické hodnocení biodiverzity, typy diverzity, indexy biodiverzity a jejich výpočet.
5. Úvod do práce v programu R a v rozhraní R Studio. Vytváření projektů, vkládání dat, grafické výstupy.
6. Jednovýběrové a dvouvýběrové testy – parametrické a neparametrické metody. Analýza kategoriálních dat – chí-kvadrát a Fisherův test.
7. Analýza rozptylu (ANOVA)- hodnocení rozptylu biologických a ekologických dat, hodnocení normality, Kruskal-Wallisův test – neparametrická alternativa analýzy rozptylu.
8. Korelační analýza – Pearsonův a Spearmanův korelační koeficient, míry podobnosti v ekologii (koeficienty podobnosti, koeficienty korelace, kovariance).
9. Regresní analýza – lineární regrese, předpoklady lineárního modelu, odhad parametrů regresního modelu, koeficient determinace, základní statistické testy.
10. Regresní analýza – polynomiální regrese, základní statistické testy, analýza reziduí regresních analýz.
11. Úvod do vícenásobné lineární regrese – typy interakcí proměnných, multikolinearita, problém chybějících dat, aplikace na biologická a ekologická data.
12. Mnohorozměrná analýza dat – základní principy, předpoklady a úprava dat před analýzou.
13. Explorativní analýzy, analýza hlavních komponent (PCA), mnohonásobná korespondenční analýza (MCA), analýza smíšených dat (FAMD), shluková analýza.
Podmínky absolvování předmětu
Výskyt ve studijních plánech
Výskyt ve speciálních blocích
Hodnocení Výuky