546-0824/01 – Mikrobiologie III (MB III)
Garantující katedra | Katedra environmentálního inženýrství | Kredity | 4 |
Garant předmětu | doc. Mgr. Hana Vojtková, Ph.D. | Garant verze předmětu | doc. Mgr. Hana Vojtková, Ph.D. |
Úroveň studia | pregraduální nebo graduální | Povinnost | povinný |
Ročník | 1 | Semestr | letní |
| | Jazyk výuky | čeština |
Rok zavedení | 2013/2014 | Rok zrušení | 2019/2020 |
Určeno pro fakulty | HGF | Určeno pro typy studia | navazující magisterské |
Cíle předmětu vyjádřené dosaženými dovednostmi a kompetencemi
Cílové kompetence v oblasti osvojení nových poznatků a jejich aplikace při řešení problémů, při pozorování, experimentování i v oblasti komunikační:
- charakterizovat fenotypové a genotypové znaky základních skupin mikroorganismů
- chápat postavení mikroorganismů v rámci ekosystémů, orientovat se v přirozených systémech a chápat fylogenetické a biotické vztahy jednotlivých skupin
- chápat postavení mikroorganismů v rámci druhové diverzity a faktory ovlivňující její stabilitu v rámci ekosystému
- chápat význam mikroorganismů v koloběhu látek v prostředí
- schopnost vyhodnotit vhodnost určitého mikroorganismu pro konkrétní biotechnologický postup s ohledem na ekologické důsledky tohoto rozhodnutí
- získané vědomosti umět využívat při řešení praktických úloh na cvičení, posoudit důsledky určitého jevu z hlediska ekologického, zdravotního i ekonomického; dotvářet si kladný vztah k přírodě
- schopnost samostatného řešení zadaných úloh, pozorovat a objektivně zaznamenávat výsledky experimentů, při práci s biologickým materiálem i technickými přístroji dodržovat zásady bezpečné (aseptické) práce
- schopnost pracovat s cizojazyčným odborným textem, zvládnout odbornou terminologii, orientovat se v základních databázích (Genbank, EMBL, FASTA) a ve světových sbírkách mikroorganismů
- schopnost synteticky vyhodnotit získané experimentální údaje, obhájit svůj názor na řešení biologického problému
Vyučovací metody
Přednášky
Experimentální práce v laboratoři
Anotace
Předmět obsahově navazuje na poznatky z obecné a speciální mikrobiologie získané v bakalářském stupni studia a rozšiřuje znalostní základ o zobecňující pohled na postavení mikroorganismů v přírodě, druhovou diverzitu a vztahy mezi populacemi mikroorganismů v rámci ekosystémů. Samostatná profilace předmětu odráží postavení moderní mikrobiologie jako multidisciplinárního oboru na rozhraní ekologických, biologických (genetických) a technických věd.
Předmět je zaměřen na mikrobiologii ekosystémů, studenti získají informace o významu mikroorganismů v širších ekologických souvislostech, o typologii mikroorganismů z hlediska jejich fenotypu a genotypu včetně moderních databází, o moderních informačních zdrojích, o možnosti jejich praktické aplikace v moderních biotechnologiích; část přednášek je věnována praktickému využití mikroorganismů k detekci mutagenů v životním prostředí a jejich úloze v degradačních technologiích i úpravnických procesech.
Povinná literatura:
Doporučená literatura:
Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta
Průběžná kontrola studia je vedena formou diskuse k přednášené problematice, praktické dovednosti jsou průběžně sledovány při práci na cvičení; pravidelné úkoly z cvičení rozšiřují teoretickou průpravu k experimentální práci.
K zápočtu studenti předloží protokoly z praktických cvičení se zpracovanými úkoly.
Studium předmětu je zakončeno zkouškou, ke které lze přistoupit až po získání zápočtu, zkouška má písemnou a ústní část.
E-learning
Další požadavky na studenta
- pravidelná účast na cvičení
- vypracování protokolů a zadaných úkolů
Prerekvizity
Předmět nemá žádné prerekvizity.
Korekvizity
Předmět nemá žádné korekvizity.
Osnova předmětu
Přehled přednášených témat:
1. Taxonomické přístupy v mikrobiologii
2. Fenotypové vlastnosti mikroorganismů, jejich hodnocení, základní fenotypizační testy
3. Genotypové vlastnosti mikroorganismů, jejich hodnocení, základní metody genotypizace
4. Významné databáze mikroorganismů, základní orientace v databázích
5. Sbírky mikroorganismů a jejich význam
6. Význam mikroorganismů v koloběhu látek v prostředí
7. Fyziologie mikroorganismů, adaptační mechanismy na úrovni metabolických procesů
8. Patogenita mikroorganismů
9. Mikroorganismy v ekosystémech, vliv prostředí na strukturu mikrobiální populace, biofilmy a jejich význam
10. Biotické vztahy v mikrobiální populaci
11. Diverzita mikroorganismů, základní faktory ovlivňující její stabilitu
12. Mikrobiální diverzita antropogenně kontaminovaných lokalit (specifické znaky), specifické znaky mikrobiální diverzity rudních ložisek a dalších surovinových zdrojů
13. Vědecké zdroje informací o mikroorganismech, přehled nejdůležitějších zdrojů informací, vědecké publikace, odborné časopisy a informační portály o mikroorganismech
14. Mikroorganismy a jejich význam v ochraně ŽP
Podmínky absolvování předmětu
Výskyt ve studijních plánech
Výskyt ve speciálních blocích
Hodnocení Výuky