546-0955/01 – Aplikovaná mikrobiologie v industriálním prostředí (AMIP)

Základní znalosti při ukončení předmětu: - charakterizovat znaky základních skupin mikroorganismů a jejich význam v biogeochemických cyklech prvků - chápat fylogenetické i biotické vztahy jednotlivých skupin mikroorganismů, jejich postavení v rámci biosféry a jejich vliv na utváření života i stabilitu současných ekosystémů - chápat význam mikroorganismů jako základních činitelů v procesech biomineralizace a biologického zvětrávání biotransformace, průmyslové a environmentální dopady těchto procesů - chápat vliv mikroorganismů na mobilitu kontaminantů v prostředí a jejich využití v procesech moderní těžby nerostů a hornin - schopnost vyhodnotit vhodnost určitého mikroorganismu pro konkrétní biotechnologický postup s ohledem na ekologické důsledky tohoto rozhodnutí - schopnost samostatně pracovat s cizojazyčným odborným textem, zvládnout odbornou terminologii, orientovat se v základních databázích mikroorganismů (Genbank, EMBL, FASTA) a ve světových sbírkách mikroorganismů; - schopnost synteticky vyhodnotit získaná experimentální data a publikovat je v českém i cizím jazyce Základní dovednosti při ukončení předmětu: - získané vědomosti využít při zpracování své disertační práce - získané znalosti uplatnit při samostatném plánování a řešení experimentů, schopnost objektivně zaznamenávat výsledky experimentální práce, schopnost zpracovat získaná data a synteticky vyhodnotit důsledky pozorovaných jevů s ohledem na další praktická využití - zhodnotit vhodnost určitého mikroorganismu pro konkrétní biotechnologický postup s ohledem na širší environmentální důsledky tohoto rozhodnutí - samostatně pracovat s cizojazyčným odborným textem, zvládnout odbornou terminologii, schopnost orientovat se v základních databázích mikroorganismů - schopnost publikovat na odborné mikrobiologické téma v českém i cizím jazyce

Předmět je zaměřen na úlohu mikrobioty v industriálním prostředí, zejména jako kontaktní bioty indikující stav životního prostředí. Předmět spojuje oblasti mikrobiální ekologie, environmentální mikrobiologie a mikrobiální biotechnologie, seznamuje s moderními metodami hodnocení mikrobioty v prostředí starých environ. zátěží. Mikrobiální rozmanitost v ekosystémech bude specifikována s ohledem na zájmové lokality dle tématu disertační práce, důraz je kladen na kvalitativní a kvantitativní metody hodnocení mikrobiálních komunit a souvisejících bioprocesů ve studovaném prostředí včetně jejich funkcí v procesech revitalizace posttěžebního prostředí.

PEŤKOVÁ, K., Ľ. JURKOVIČ a H. VOJTKOVÁ. Bioremediačný potenciál baktérií v uvoľňovaní arzénu z pochovaných elektrárenských popolov. Ostrava: VŠB-TU Ostrava, 2016. 150 s. ISBN 978-80-248-3999-8 VOJTKOVÁ, H. Pseudomonas: New Isolates of Metal Resistant Bacteria from the Anthropogenic Sediment of Settling Basins. Košice: TU Košice – Fakulta BERG, 2014. 109 s. ISBN 978-80-553-1839-4 SARETHY, I. P., S. PAN a M. K. DANQUAH. Modern Taxonomy for Microbial Diversity. London: IntechOpen, 2014. ISBN 978-953-51-1315-7 ZENGLER, K. Accessing Uncultivated Microorganisms: From the Environment to Organisms and Genomes and Back. Washington DC: ASM Press, 2008. 308 s. ISBN 978-1-55581-406-9

aktivní účast na konzultacích k tématu disertační práce zpracování odborné rešerše na zadané téma vztahující se k disertační práci ústní zkouška