546-0981/01 – Geomikrobiologie (GMB)

Základní znalosti při ukončení předmětu: - charakterizovat znaky základních skupin mikroorganismů a jejich význam v biogeochemických cyklech prvků - chápat fylogenetické i biotické vztahy jednotlivých skupin mikroorganismů, jejich postavení v rámci biosféry a jejich vliv na utváření života i stabilitu současných ekosystémů - chápat význam mikroorganismů jako základních činitelů v procesech biomineralizace a biologického zvětrávání biotransformace, průmyslové a environmentální dopady těchto procesů - chápat vliv mikroorganismů na mobilitu kontaminantů v prostředí a jejich využití v procesech moderní těžby nerostů a hornin - schopnost vyhodnotit vhodnost určitého mikroorganismu pro konkrétní biotechnologický postup s ohledem na ekologické důsledky tohoto rozhodnutí - schopnost samostatně pracovat s cizojazyčným odborným textem, zvládnout odbornou terminologii, orientovat se v základních databázích mikroorganismů (Genbank, EMBL, FASTA) a ve světových sbírkách mikroorganismů; - schopnost synteticky vyhodnotit získaná experimentální data a publikovat je v českém i cizím jazyce Základní dovednosti při ukončení předmětu: - získané vědomosti využít při zpracování své disertační práce - získané znalosti uplatnit při samostatném plánování a řešení experimentů, schopnost objektivně zaznamenávat výsledky experimentální práce, schopnost zpracovat získaná data a synteticky vyhodnotit důsledky pozorovaných jevů s ohledem na další praktická využití - zhodnotit vhodnost určitého mikroorganismu pro konkrétní biotechnologický postup s ohledem na širší environmentální důsledky tohoto rozhodnutí - samostatně pracovat s cizojazyčným odborným textem, zvládnout odbornou terminologii, schopnost orientovat se v základních databázích mikroorganismů - schopnost publikovat na odborné mikrobiologické téma v českém i cizím jazyce

Předmět rozšiřuje znalostní základ o zobecňující pohled na postavení mikroorganismů na planetě Zemi i jejich úlohu v biotransformačních procesech prvků při utváření funkčních bio-geochemických vztahů v ekosystémech. Předmět je zaměřen na interakci mikroorganismů s nerosty a horninami, studenti získají informace o významu mikroorganismů v širších geochemických souvislostech, neboť jako aktivní biologičtí činitelé aktivně zasahují do struktury minerálů a tím přispívají k utváření surovinových zdrojů. Předmět shrnuje poznatky o úloze mikroorganismů při získávání a zpracování nerostných surovin, o možnostech jejich praktické aplikace v úpravnických procesech, v technologiích využití odpadů po těžbě a zpracování nerostných surovin a jejich úloze v revitalizaci prostředí po důlní a průmyslové činnosti.

KONHAUSER, K. Introduction to Geomicrobiology. Wiley-Blackwell, 2006. 440 s. ISBN 978-063205454-1. FRANKOVSKÁ, J., I. SLANINKA a J. KORDÍK. Atlas sanačných metód environmentálnych záťaží. Bratislava: ŠGÚDŠ, 2010. ISBN 978-80-89343-39-3. LHOTSKÝ, J. Úvod do studia symbiotických interakcí mikroorganismů: nový pohled na viry a bakterie. Praha: Academia, 2015. ISBN 978-80-200-2480-0 PRASAD, M. N. V., K. S. SAJWAN a R. NAIDU, ed. Trace Elements in the Environment: Biogeochemistry, Biotechnology, and Bioremediation. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 2006. ISBN 1-56670-685-8

aktivní účast na konzultacích k tématu disertační práce zpracování odborné rešerše na zadané téma vztahující se k disertační práci ústní zkouška