9360-0239/01 – Molekulární modelování pomocí silových polí (MMSP)
| Garantující katedra | Centrum nanotechnologií | Kredity | 10 |
| Garant předmětu | doc. Ing. Jonáš Tokarský, Ph.D. | Garant verze předmětu | doc. Ing. Jonáš Tokarský, Ph.D. |
| Úroveň studia | postgraduální | Povinnost | povinně volitelný typu B |
| Ročník | | Semestr | zimní + letní |
| | Jazyk výuky | čeština |
| Rok zavedení | 2020/2021 | Rok zrušení | |
| Určeno pro fakulty | FMT | Určeno pro typy studia | doktorské |
Cíle předmětu vyjádřené dosaženými dovednostmi a kompetencemi
Student bude schopen identifikovat problém řešitelný molekulárním modelováním,
identifikovat relevantní data nutná k postavení iniciálního modelu, aplikovat vhodnou strategii molekulárního modelování, diskutovat a interpretovat výsledky molekulárních simulací.
Vyučovací metody
Přednášky
Individuální konzultace
Cvičení (v učebně)
Anotace
Cílem předmětu je prohloubit schopnosti studenta rozpoznat problém řešitelný metodami molekulárního modelování. V rámci předmětu budou probírány zejména otázky vstupních experimentálních dat, výběru vhodné modelovací strategie a interpretace výsledků získaných molekulárním modelování. Vzhledem k použité metodě molekulárních simulací pomocí silových polí není tento předmět zaměřen na elektronové vlastnosti materiálů, ale na jejich strukturu a chování za daných podmínek. Praktická cvičení, která jsou hlavním obsahem tohoto předmětu, jsou zaměřena např. na povrchovou modifikaci, interkalaci, sorpci, mísitelnost, ale rovněž na simulaci rentgenové difrakce či infračervených spekter. V rámci předmětu budou studentům také poskytnuty ukázky úspěšných aplikací metod molekulárního modelování v materiálovém výzkumu.
Povinná literatura:
Doporučená literatura:
POSPÍŠIL, M. a M. VETEŠKA. Výpočetní postupy v molekulární dynamice. Materials Structure. 2012, roč. 19, č. 2, s. 71-74
Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta
Studijní výsledky jsou ověřovány průběžně v rámci cvičení. Výsledky cvičení jsou zpracovány ve formě pěti protokolů (max. 4 body za protokol, požadované minimum 2 body). Je vypracována samostatná semestrální práce (max. 20 bodů, požadované minimum 10 bodů). Body za zápočet jsou dány body za protokoly a semetrální práci (max. 40 bodů, požadované minimum 20 bodů). Následuje ústní zkouška (max. 60 bodů, požadované minimum 31 bodů).
E-learning
Další požadavky na studenta
Písemné protokoly z praktických cvičení.
Prerekvizity
Předmět nemá žádné prerekvizity.
Korekvizity
Předmět nemá žádné korekvizity.
Osnova předmětu
Identifikace problému řešitelného molekulárním modelováním s využitím silových polí.
Identifikace, interpretace a využití výsledků instrumentálních analytických metod pro potřeby přípravy iniciálního modelu.
Základní chemické výpočty pro potřeby přípravy iniciálního modelu.
Výběr modelovací strategie pro řešený problém.
Interpretace výsledků molekulárního modelování a komparace s experimentálními daty.
Molekulární modelování interkalátů (praktické cvičení).
Molekulární modelování mísitelnosti vybraných látek (praktické cvičení).
Molekulární modelování sorpce malých molekul (praktické cvičení).
Molekulární modelování nanočástic na anorganickém substrátu (praktické cvičení).
Simulace rentgenové difrakce anorganických a organických struktur (praktické cvičení).
Simulace infračervených spekter vybraných látek (praktické cvičení).
Podmínky absolvování předmětu
Výskyt ve studijních plánech
Výskyt ve speciálních blocích
Hodnocení Výuky
Předmět neobsahuje žádné hodnocení.