9600-1012/01 – Úvod do molekulových simulací (UMS)

Garantující katedra	IT4Innovations	Kredity	4
Garant předmětu	prof. RNDr. René Kalus, Ph.D.	Garant verze předmětu	prof. RNDr. René Kalus, Ph.D.
Úroveň studia	pregraduální nebo graduální	Povinnost	povinně volitelný typu A
Ročník	2	Semestr	letní
		Jazyk výuky	čeština
Rok zavedení	2016/2017	Rok zrušení	2021/2022
Určeno pro fakulty	FMT	Určeno pro typy studia	navazující magisterské

Výuku zajišťuje
Os. čís.	Jméno	Cvičící	Přednášející
KAL0063	prof. RNDr. René Kalus, Ph.D.
VIT0060	Mgr. Aleš Vítek, Ph.D.

Rozsah výuky pro formy studia
Forma studia	Zp.zak.	Rozsah
prezenční	Zápočet a zkouška	2+1
kombinovaná	Zápočet a zkouška	10+5

Cíle předmětu vyjádřené dosaženými dovednostmi a kompetencemi

Po absolvování předmětu bude student schopen: - aktivně používat pojmy z oblasti molekulových simulací metodami Monte Carlo a molekulové dynamiky, - implementovat jednoduché modely, - provést počítačové simulace a zpracovat jejich výsledky, - rozšířit si získané znalosti oboru samostatným studiem.

Vyučovací metody

Přednášky
Cvičení (v učebně)

Anotace

V rámci tohoto předmětu si posluchači osvojí teoretické základy molekulárního modelování a budou seznámeni s problematikou molekulární dynamiky a metod Monte Carlo.

Povinná literatura:

1.Nezbeda, I., Kolafa J., Kotrla M. Úvod do počítačových simulací. Metody Monte Carlo a molekulární dynamiky, Karolinum, Praha 2003, ISBN 80-246-0649-6. 2.Allen, M.P., Tildesley, D.J. Computer Simulations of Liquids. Oxford Science Publications, Oxford 1989, ISBN 0-19-855645-4.

Doporučená literatura:

1.Hinchliffe, A., Molecular modelling for beginners, Second edition, John Wiley & Sons Ltd, Chichester 2008, ISBN 978-0-470-51313-2.

Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta

E-learning

Další požadavky na studenta

Žádné další požadavky.

Prerekvizity

Předmět nemá žádné prerekvizity.

Korekvizity

Předmět nemá žádné korekvizity.

Osnova předmětu

1. Repetitorium klasické statistické termodynamiky, statistické soubory. 2. Repetitorium klasické mechaniky, pohybové rovnice. 3. Molekulové a mezimolekulové interakce, silová pole. 4. Metody molekulární dynamiky pro NVE soubor. 5. Metody molekulární dynamiky pro další statistické soubory. 6. Numerické řešiče pohybových rovnic. 7. Markovovy řetězce, přechodové matice, Metropolisův algoritmus. 8. Generátory pseudonáhodných čísel. 9. Metody Monte Carlo pro NVT soubor. 10. Metody Monte Carlo pro další statistické soubory. 11. Metody urychlení konvergence (parallel tempering). 12. Repetitorium kvantové mechaniky a kvantové statistické termodynamiky. 13. Kvantové metody Monte Carlo.

Podmínky absolvování předmětu

Prezenční forma (platnost od: 2019/2020 zimní semestr, platnost do: 2021/2022 letní semestr)

Název úlohy	Typ úlohy	Max. počet bodů (akt. za podúlohy)	Min. počet bodů	Max. počet pokusů
Zápočet a zkouška	Zápočet a zkouška	100 (100)	51
Zápočet	Zápočet
Zkouška	Zkouška	100	51	3

Rozsah povinné účasti: Vypracování samostatného projektu a jeho prezentace, ústní zkouška.

Zobrazit historii

Podmínky absolvování předmětu a účast na cvičeních v rámci ISP:

Zobrazit historii

Výskyt ve studijních plánech

Akademický rok	Program	Zaměření	Forma	Jazyk výuky	Konz. stř.	Ročník	Typ povinnosti
2021/2022	(N0719A270002) Nanotechnologie	MM1	P	čeština	Ostrava	2	povinně volitelný typu A	stu. plán
2020/2021	(N0719A270002) Nanotechnologie	MM1	P	čeština	Ostrava	2	povinně volitelný typu A	stu. plán
2019/2020	(N0719A270002) Nanotechnologie	MM1	P	čeština	Ostrava	2	povinně volitelný typu A	stu. plán

Výskyt ve speciálních blocích

Název bloku	Akademický rok	Forma studia	Jazyk výuky	Ročník	Z	L	Typ bloku	Vlastník bloku

Hodnocení Výuky

Předmět neobsahuje žádné hodnocení.