9600-1012/01 – Úvod do molekulových simulací (UMS)
Garantující katedra | IT4Innovations | Kredity | 4 |
Garant předmětu | prof. RNDr. René Kalus, Ph.D. | Garant verze předmětu | prof. RNDr. René Kalus, Ph.D. |
Úroveň studia | pregraduální nebo graduální | Povinnost | povinně volitelný typu A |
Ročník | 2 | Semestr | letní |
| | Jazyk výuky | čeština |
Rok zavedení | 2016/2017 | Rok zrušení | 2021/2022 |
Určeno pro fakulty | FMT | Určeno pro typy studia | navazující magisterské |
Cíle předmětu vyjádřené dosaženými dovednostmi a kompetencemi
Po absolvování předmětu bude student schopen:
- aktivně používat pojmy z oblasti molekulových simulací metodami Monte Carlo a molekulové dynamiky,
- implementovat jednoduché modely,
- provést počítačové simulace a zpracovat jejich výsledky,
- rozšířit si získané znalosti oboru samostatným studiem.
Vyučovací metody
Přednášky
Cvičení (v učebně)
Anotace
V rámci tohoto předmětu si posluchači osvojí teoretické základy molekulárního modelování a budou seznámeni s problematikou molekulární dynamiky a metod Monte Carlo.
Povinná literatura:
Doporučená literatura:
Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta
E-learning
Další požadavky na studenta
Žádné další požadavky.
Prerekvizity
Předmět nemá žádné prerekvizity.
Korekvizity
Předmět nemá žádné korekvizity.
Osnova předmětu
1. Repetitorium klasické statistické termodynamiky, statistické soubory.
2. Repetitorium klasické mechaniky, pohybové rovnice.
3. Molekulové a mezimolekulové interakce, silová pole.
4. Metody molekulární dynamiky pro NVE soubor.
5. Metody molekulární dynamiky pro další statistické soubory.
6. Numerické řešiče pohybových rovnic.
7. Markovovy řetězce, přechodové matice, Metropolisův algoritmus.
8. Generátory pseudonáhodných čísel.
9. Metody Monte Carlo pro NVT soubor.
10. Metody Monte Carlo pro další statistické soubory.
11. Metody urychlení konvergence (parallel tempering).
12. Repetitorium kvantové mechaniky a kvantové statistické termodynamiky.
13. Kvantové metody Monte Carlo.
Podmínky absolvování předmětu
Výskyt ve studijních plánech
Výskyt ve speciálních blocích
Hodnocení Výuky
Předmět neobsahuje žádné hodnocení.